Этот сайт использует файлы cookie и метаданные. Продолжая просматривать его, вы соглашаетесь на использование нами файлов cookie и метаданных в соответствии с Политикой конфиденциальности.
Продолжить
HLA-гаплотипы потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России
Журнал входит в перечень ведущих рецензируемых научных изданий ВАК. Импакт-фактор РИНЦ - 0,696
3 Ноября 2021 года
HLA-гаплотипы потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России, исследованных методом секвенирования следующего поколения
Авторы: В. Г. Савченко , Т. В. Гапонова , С. П. Хижинский , А. Р. Абдрахимова , Е. А. Леонов , Е. Г. Хамаганова
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр гематологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Москва

Подробности статьи

Резюме: Изучено распределение двух- и пятилокусных HLA-гаплотипов у доноров гемопоэтических стволовых клеток регистра ФГБУ «НМИЦ гематологии» Минздрава России с самоидентификацией как русские, а также неравновесное сцепление HLA-генов в двухлокусных гаплотипах. В исследование включено 1510 доноров. HLA-типирование проводили с использованием набора AllType NGS Amplification Kits (One Lambda, США). HLA-типирование генов класса I проведено с полным секвенированием, включая нетранслируемые области генов, генов класса II — на уровне 2–3-го полей. Для анализа полученных в результате секвенирования последовательностей HLA-генов использована компьютерная программа TypeStream Visual Software (TSV) (One Lambda, США). С помощью Arlequin 3.5 рассчитаны частоты HLA-гаплотипов, а также стандартизованное значение неравновесного сцепления генов. Выявлено, что большая часть доноров регистра «НМИЦ гематологии» являются носителями распространенных HLA-гаплотипов, однако большое разнообразие HLA-гаплотипов связано с присутствием длинной череды редких гаплотипов, для носителей которых подобрать полностью HLA-совместимого донора проблематично даже при значительной численности регистра. HLA-аллели, отличающиеся всего лишь по нуклеотидной замене в нетранслируемой области гена, определяются в составе разных HLA-гаплотипов с неодинаковым неравновесным сцеплением генов в гаплотипе. Сцепление HLA-аллелей наиболее сильно выражено для гаплотипов, входящих в основные блоки HLA-гаплотипов, это: HLA-DRB1-DQB1 и HLA-B-С. Конкретные пары аллелей генов, составляющие HLA-гаплотипы одного блока, могут значительно различаться между собой по силе сцепления. Пятилокусные гаплотипы HLA-A-B-C-DRB1-DQB1 в основном сформированы из двухлокусных HLA-гаплотипов с сильным неравновесным сцеплением аллелей в каждой паре генов. Установленные в исследовании HLA-гаплотипы могут быть использованы для анализов результатов HLA-типирования с целью верификации возможных гаплотипов при выборе оптимально совместимого донора для аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.
Полный текст: Полный текст статьи доступен по платной подписке